在分子生成与虚拟筛选的定制交付中,我们把流程拆成生成、过滤、对接、复核四段,每段保留可解释的中间产物,便于客户回溯与调整。生成阶段以靶点口袋或已知活性骨架为条件,用片段约束与骨架跃迁控制化学空间的探索方向,而不是无约束地追求“新”。过滤阶段叠加类药性、PAINS、合成可行性与专利预警规则,把动辄百万级的候选压到万级。
要点:
- 阶段进展:在某激酶靶点上,从约 20 万条生成分子出发,经三重过滤保留约 1.1 万条,对接与共识打分后人工复核 30 条,客户实测获得 2 个微摩尔级活性化合物,实际送样合成 12 个。
- 下一步:接入主动学习与相对自由能微扰(FEP)做二级排序,将每轮湿实验验证的化合物数压缩到 10 个以内,并建立评分函数误差的校准基线。
需要说明的是,生成模型仍受训练数据偏倚与打分函数误差的影响。我们不承诺“凭空造出成药分子”,只承诺把可验证的候选集做小、做稳、可复现。

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