在分子生成与虚拟筛选的定制交付中,我们把流程拆成三段:条件生成、级联筛选、可合成性复核。生成阶段以靶点口袋特征与类药性约束为条件,单轮产出1万~5万条SMILES,经去重、标准化与盐离子剥离后通常保留六成左右;筛选阶段先按QED、SAscore与常见毒性预警做快速过滤,再用对接打分对前5%精筛,最终人工复核top 200。级联的价值在于把算力花在能通过的分子上,而非全量精算。
要点:
- 数据切分必须按Murcko骨架划分。随机划分会让同骨架分子同时落入训练与测试集,活性预测AUC可虚高0.1~0.15,这是我们在复现外部模型时最常见的指标失真来源。
- 下一步计划将ADMET预测并入第二级过滤,并用3~5个已知靶点做回溯验证,用命中率而非生成数量衡量交付质量。

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