在AI药物研发实验室本阶段的工作中,我们把重点放在“生成—筛选—排序”链路的可复现性上,而非单纯追求生成分子的数量。
进展:搭建了一套以靶点结构为约束的分子生成与虚拟筛选流水线。生成端采用条件生成模型,支持指定骨架或药效团片段做约束采样;筛选端先做类药性、合成可行性与结构告警过滤,再用对接打分与打分函数一致性校准做二级排序,减少单一打分带来的假阳性。
数据:在内部三个靶点的测试集上,对约20万条生成分子执行上述流程,Top-1% 的对接富集率相较随机枚举基线提升约2.4倍,单轮全流程耗时由数天压缩至数小时;同时保留了每条候选的生成条件与筛选轨迹,便于回溯与复现。
下一步:从中选取少量候选进入湿实验做结合活性验证,并用实测结果反向校准打分函数与生成模型的约束权重,逐步形成“生成—筛选—实验”的小闭环。

评论